Après les événements dramatiques, Alex a quitté le FBI mais continue de travailler incognito. Elle occupe un emploi de bureau à la CIA, vit avec Shelby et fréquente toujours Ryan. Alex se rend à la Ferme, un camp d'entraînement secret de la CIA, où elle collabore avec le FBI. Mais bientôt, quand des dirigeants politiques importants sont pris en otage par des terroristes, Alex doit reprendre du service...