Le nombre des crocodiles marins a diminué, Thaïlande, Cambodge, Laos et Vietnam, devenant extrêmement rare. Ll’espèce est même proche de l’extinction dans un ou plusieurs de ces pays.
Il est le crocodilien le moins susceptible de devenir totalement éteint grâce à sa large répartition en Australie du Nord et en Nouvelle-Guinée.
En Inde, ce crocodile est extrêmement rare dans la plupart des zones mais est très commun dans la partie nord-est du pays, principalement l’Orissa et le Sundarbans. La population est sporadique en Indonésie et Malaisie où certaines zones abritent de larges populations et d’autres de très petites populations « à risque. »
Le crocodile marin est également présent dans des zones très limitées du Pacifique Sud, avec une population moyenne dans les îles Salomon, une très petite population proche de l’extinction, la population se résumant officiellement à trois individus, à Vanuatu et une population correcte mais à risque aux Palaos
